在醫學上，硼砂用于皮膚黏膜的消毒防腐、氟骨癥、足癬、牙髓炎、霉菌性陰道炎、宮頸糜爛、褥瘡、痤瘡、外耳道濕疹、皰疹病毒性皮膚病、癲癇的治療，用于腫瘤的治療。在動物醫學上，硼砂用于雞喉氣管炎、山羊傳染性膿皰病、豬支原體肺炎、牛慢性黏液性子宮內膜炎的治療，作為飼料添加劑也備受人們的關注。
用于除草劑，用于非耕作區滅生性除草，除單獨使用外，同氯酸鈉混用，以減低氯酸鈉的易燃性。
在工業上，硼砂為最重要的工業硼礦物。硼砂是硼最重要的化合物。硼在國外常被列為稀有元素，然而在我國卻有豐富的硼砂礦，因此，硼在我國不是稀有元素，而是豐產元素。在工業上硼砂也作為固體潤滑劑用于金屬拉絲等方面。在電冰箱、電冰柜、空調等制冷設備的焊接維修中常做為（非活性）助焊劑用以凈化金屬表面。清除金屬表面上的氧化物；在硼砂中加入一定比例的氯化鈉。氟化鈉、氯化鉀等化合物即可作為活性助焊劑用于制冷設備中銅管和鋼管、鋼管與鋼管之間的焊接。
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